1.增加產(chǎn)量。實踐證明，微生物肥料中的肥效為作物提供養(yǎng)分，而且其有效菌還能分泌赤霉素、生長素等活性物質(zhì)，刺激、調(diào)節(jié)和促進作物的生長發(fā)育，有利于作物增產(chǎn)。

2.提高質(zhì)量。微生物肥料能有效提高農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)。實踐證明，施用微生物肥料收獲的農(nóng)產(chǎn)品蛋白質(zhì)、糖、維生素、氨基酸等有益成分含量顯著增加，谷物和水果飽滿光滑，果實色澤鮮艷，口感好，價值高。一些微生物肥料產(chǎn)品也可以減少硝酸鹽的積累

3.增強作物的抗逆性。多種活性酶功能，能控制或殺滅病原菌，減少病害的發(fā)生，增強作物的抗逆性，能增強作物的抗旱性、抗寒、抗倒伏、防病、抗鹽堿，能有效防止作物生理病害的發(fā)生。

4.提高化肥利用率。大多數(shù)微生物有效菌能分解土壤中的有機質(zhì)，有機質(zhì)分解過程中產(chǎn)生腐植酸，腐植酸與土壤中的氮形成腐植酸銨，可以減少氮肥的流失。解鉀溶磷有效菌可將土壤中固化的化學(xué)鉀肥和化學(xué)磷肥分解轉(zhuǎn)化為有效鉀和有效磷，提高其利用率，減少生產(chǎn)投資，減少環(huán)境污染

5.提高土壤養(yǎng)分。有效菌能促進土壤中不溶性養(yǎng)分的溶解和釋放，提高土壤養(yǎng)分供應(yīng)能力。有效菌分泌的胞外多糖是土壤團粒結(jié)構(gòu)的粘合劑，可以強化土壤團粒結(jié)構(gòu)，疏松土壤，提高土壤滲透性和保水保肥能力，增加土壤有機質(zhì)。